Sí, el usuario decide cuales videos se monetizan en ese caso.
Si tu estado de cuenta no es bueno, puede reducir las posibilidades de ser aprobado, particularmente si hay una infracción de copyright (se retiró un video)
http://www.youtube.com/account_manage, pero las coincidencias de ID también pueden ser un problema para ser aprobado, lo recomendable es no tenerlas, o las menos posibles.
Se supone que es un equipo de personas quien revisa las solicitudes, todo depende de ellos y de tus contenidos, nadie te puede asegurar que ser{as aprobado o rechazado. En caso de no lograrlo, puedes volver a intentarlo en un par de meses.