Con archivos de gran tamaño no me extraña que el contador no pueda calcular con precisión el tiempo de subida. Deberías intentar desde otros navegadores o equipos para ver si el comportamiento es similar.
Por cierto, para archivos de más de 2GB debes usar la herramienta de subida avanzada (Java) que permite hasta 20GB, la página de subida regular sólo permite un máximo de 2GB, así que probablemente tu subida sea rechazada al final si la estás subiendo por allí.
