No es recomendado que utilice ese tipo de programas porque pueden robarle sus cuentas por usarlos ademas de ello que eso puede ir en contra de las politicas de uso de la plataforma de dicho servicio.
En teoria no deberia afectar pero normalmente esos programas suelen incluir funciones que puedan afectar su dispositivo como meterle publicidad por todo lado o que le roben su cuenta o que instalen otras aplicaciones y en temas de seguridad cualquier cosa puede pasar.
De todas formas nadie puede garantizarle que no puedan afectar su cuenta de YouTube porque solo los desarrolladores de dichos programas saben que hacen esos programas.
Saludos