No han hecho ningún cambio, sólo están desarrollando una alternativa, especialmente útil para dispositivos que no son compatibles con flash. Ellos dijeron que seguirán ofreciendo reproducción con flash, no tienes que usar html5 si no lo deseas.
Si por alguna razón el reproductor html5 está activado sin haberlo hecho tú manualmente, entonces puedes desactivarlo desde
youtube.com/html5