La mayoría de la música de las grandes discográficas está registrada en el sistema de identificación de contenidos de YouTube, pero es decisión de las discográficas eliminar, bloquear o monetizar los vídeos identificados.
Algunas veces el dueño de los derechos puede decidir bloquear el vídeo y/o añadirle anuncios publicitarios que beneficiarían únicamente al reclamante. Otras veces lo reclama completamente y pide su eliminación. Si no tienes los derechos, estás a merced de lo que ellos decidan. Que otros vídeos sigan disponible en el sitio, no significa que pasará lo mismo con el tuyo...
La mayoría de veces YouTube identifica el uso del contenido, pero no siempre su dueño decide eliminarlo. Lo recomendable es no subir contenidos de los que no tienes autorización o licencia para publicar en YT :/