No hay forma en que YouTube los sepa en ese caso (YT sólo actúa al recibir una reclamación de copyright o aplican las políticas adoptadas por el dueño del contenido si este está registrado en el sistema de identificación y gestión).
Si efectivamente obtienes la autorización del dueño del contenido, debes asegurarte de que quede claro (con él) cuáles son los vídeos o canales en los que lo usarás para que no hayan reclamaciones erróneas . Las compañías que se registran en el sistema de gestión de contenidos pueden añadir usuarios a la lista de excepciones (lista blanca) y evitar esos inconvenientes.
