Eso probablemente se debe a que el vídeo destacado está monetizado. Si lo has subido tú y no lo monetizaste, entonces es probable que tenga una coincidencia de ID de contenido o que hayas usado música de la librería de audio de YouTube (en ambos casos pueden aparecer anuncios). Todos ls canales pueden llegar a mostrar anuncios si el vídeo que el usuario destaque se encuentra monetizado.
Si solicitaste ser partner y eres aprobado, YouTube se lo notifica al usuario, además de que es fácilmente notable en la cuenta y canal. Si se trata de un canal de marca, seguramente el representante de YouTube te notificará cuando todo estará listo.