Si dices que están vinculadas al mismo correo, es porque seguramente una de ellas está vinculada a una cuenta Google y la otra no. Si recuerdas la contraseña de la cuenta a la que no puedes acceder, entonces cierra sesión en YouTube y después accede con el nombre de usuario en cuestión y su respectiva contraseña. El sistema te pedirá que vincules el canal a una cuenta Google y cuando lo hagas deberías poder acceder a él.