Yo uso el bloc de notas para crear un archivo de texto simple, y los subtítulos los escribo en éste formato (sbv), con el momento de aparición y de salida del texto separados por una coma y se escribe la línea abajo...
http://support.google.com/youtube/bin/answer.py?hl=es&answer=100076
Seguramente hay otros formatos, pero ese es el que yo uso personalmente. Revisa los dos enlaces que aparecen arriba. Ejemplo:
0:00:00.000,0:00:02.500
¡Aquí vienen, por arriba!
0:00:06.000,0:00:07.600
¡Dale dale dale!
0:00:11.000,0:00:13.819
- ¡más en la calle, a la izquierda!
0:00:23.800,0:00:28.600
Me gusta. Pongamos aquí el sillón, y por ahí el sofá..