Si las coincidencias de ID de contenido eran la única razón por la que la cuenta no estaba en buen estado, entonces sí, la cuenta probablemente volverá a tener un buen estado después de eliminar los videos en cuestión.
Por otro lado, si han rechazado varios de los videos que has tratado de monetizar y no logras demostrar que tienes los derechos necesarios para usar comercialmente el contenido, podrían desactivar la obtención de ingresos para todo el canal.