podrias usar un programa como Camtasia Studio 6, que en el eliges las dimensiones, si le pones las sagradas dimensiones 640x360 (medida muy buena que YouTube deberia mencionar) podrias subir el video, no será HD pero llanará la pantalla panoramica de YouTube
Yo uso esas medidas para aprovechar toda pantalla del reporductor YouTube y no tener que subir videos en HD que tardan 2 horas en subirse