¿Cuándo fue creada la cuenta? Si fue creada muy recientemente, eso podría explicar el límite tan bajo, éste aumenta con la antiguedad de la cuenta. Los vídeos añadidos anteriormente no deberían desaparecer al añadir nuevos, un mensaje de error debería impedirte añadir más ¿Cuál es el nombre del canal?
Las listas de reproducción tienen un límite de 200 vídeos ¿Estás seguro de que estás añadiendo a favoritos y no a una lista de reproducción normal?