Si usaste material con copyright en el vídeo (música incluida), entonces no hay mucho que hacer, porque el dueño del material usado seguramente decidió bloquearlo. Es una lástima que arruinen tu vídeo así, pero la ley y las compañías/discográficas no les importa la intención con que el material fue usado (en términos generales).
Si el bloqueo es porque usaste música con copyright, quizá quieras probar la herramienta de cambio de audio y seleccionar alguno de los temas que ofrece YouTube. El cambio de audio reemplazará completamente el audio original, pero permitirá que el vídeo vuelva a estar disponible para todos, dirígete a
http://www.youtube.com/my_videos >> [Editar] (del vídeo en cuestión)
>> Cambiar audio/AudioSwap.
...o también puedes volver a subir el vídeo usando un tema libre de copyright o con licencias creative commons que no tiene ese tipo de problemas.