Probablemente hay varias formas en las que YouTube puede hacer eso, pero la más usual es la vinculación de direcciones de correo... es decir, si usas una misma dirección de correo que hayas usado otra cuenta anteriormente.
Generalmente eso no significa nada, pero si alguna de las cuentas tiene infracciones de algún tipo, o fue suspendida, esas acciones pasarán a cualquier otra cuenta si el sistema encuentra alguna relación.
