1. Algunas pueden afectar algunas funciones de la cuenta, especialmente aquellas coincidencias en las que el video fue bloqueado, pero no afectan el estado de cuenta directamente. Tener varias quizás no sea un problema, pero tienen el potencial de serlo, ya que los dueños del contenido pueden cambiar e opinión cuando quieran.
3. YouTube no dice nada específico. Si se trata de un video en el que enseñas y analizas objetivamente y limitas la aparición del contenido y marcas a lo mínimo posible, quizás lo puedas monetizar, pero es YouTube quien decide si lo acepta o no, y con el tiempo he visto a usuarios que nunca han tenido problemas y otros a los que se le rechaza en varias ocasiones :/
4. ¿YouTube?, no lo creo. Los dueños del contenido reclamado, posiblemente, aunque es muy poco probable que ocurra.
4 1/2. Probablemente necesitarás autorización del dueño de los derechos de la versión original para publicar y usar comercialmente esa versión.