Java reanudaba la subida automáticamente si la comunicación se interrumpía y restablecía (el usuario no lo podía controlar directamente), pero si el usuario cancelaba manualmente la subida o cerraba la ventana del navegador, la subida no es reanudable con ese sistema.
Recientemente se ha añadido nueva tecnología a la página de subidas regular que permite subidas realmente reanudables. Para usarla sólo debes acceder a la página de subidas normal desde Chrome o Firefox 4+ que son los navegadores compatibles con esta tecnología por ahora. Si cierras la ventana o apagas el equipo, la próxima vez que intentes subir el mismo archivo, el sistema debería continuar desde el punto en que quedó la última vez.