¿Qué error te sale? En principio no debería darte problemas el formato, puesto que es uno de los que permite Youtube:
https://support.google.com/youtube/troubleshooter/2888402?hl=es-419 / En todo caso si me detallas más en qué consiste el error, podría brindarte una solución directa. Por ahora solo te puedo decir que no es el formato en sí lo que debe causar el error pero pueden ser otros muchos factores como la red, o un archivo demasiado pesado.
