Al iniciar sesión en YouTube inicias sesión en una cuenta Google, así ha sido desde el 2009, cuando YouTube comenzó a ser integrado a ese sistema directamente. La apariencia de la página de inicio de sesión cambió hace algunas semanas, pero sigue funcionando de la misma forma hasta donde sé.
Desde hace varios meses, YouTube no permite iniciar sesión con el nombre del canal, sino con la dirección de correo de la cuenta Google en su lugar (en muchos casos), pero sigue aceptando nombres cortos de Gmail si esa cuenta Google tiene una dirección de Gmail... supongo que es eso a lo que te refieres.
En fin, YouTube ya no ofrece la opción de desvincular canales creados antes de 2009 directamente, en su lugar ofrece vincular el canal a una página de Google+ y añadir la otra cuenta google como administrador, cosa que no creo que sirva para lo que quieres.