Hola László,
Cuando aparece la leyenda "Comentario Enlazado" junto a un comentario, significa que has accedido a un enlace que te lleva a un comentario especifico en la pagina de visualización de un video.
Puede tratarse de la campana de Google+ o alguien que ha compartido contigo ese enlace.
El motivo por el cual no puedes responder esos comentarios, se debe a la configuración del autor de ese comentario.
No hay nada que puedas hacer.
Para obtener el enlace de un comentario, puedes ver este video del canal de YouTube Help en ingles, pero con subtitulos en Español que te lo explica:
