Actualmente no hay un código que se pueda insertar a la URL y que reproduzca el vídeo sin anotaciones. Puedes desactivarlas desde las opciones de la barra de reproducción (ver imagen) o desactivarlas totalmente desde
Cuenta > Configuración de reproducción > Anotaciones http://www.youtube.com/account#playback/annotations. Al modificar estas opciones, solo harán efecto en ti.
¡Suerte! :)