Exacto, un bug de YouTube. Lo único que puedes hacer ahora es informar e ignorar el bug hasta que lo arreglen. Tampoco te vas a morir por tener una respuesta en vídeo inexistente xD.
Cuando tengas una nueva, lo lógico es que ponga que tienes dos y que solo te aparezca una en la bandeja.
Además, si se borra un vídeo, también se borran todos sus comentarios, enlaces, puntuaciones, y respuestas de vídeo.