No es posible silenciar total o parcialmente un vídeo subido por tí a YouTube, sólo está la opción de usar la herramienta de cambio de audio, pero casi toda esa música está monetizada por sus respectivas discográficas o publicadoras, así que serían inelegibles para reparto de ingresos.
La próxima vez deberás usar música con licencias que te permitan el uso comercial... y si lo deseas, puedes tratar de volver a subir los vídeos editados, pero comenzarían desde cero.