El programa guarda proyectos de Windows Movie Maker, para continuar trabajando en la edición.
Una vez que termines (que es lo que tú ya has hecho), y estés listo para convertirlo a video, debes darle clic en archivo y a "Publicar película" o "Guardar archivo de película" (según la versión que tengas, vista, 7 o xp).
Estan los formatos de .Avi y .Wmv. El Avi es más pesado que el Wmv. Yo te aconsejo el Wmv, para una subida más rapida a Youtube.
Saludos