Hola,
Desde YouTube, los propietarios de material, pueden monetizar los videos de los usuarios que utilizan su contenido.
También, pueden bloquearlos u obtener las reproducciones.
Todo esto, se hace desde el sistema de identificación de contenido de YouTube (Content ID).
Lo que mencionas de cobrar los Royalties...
Exactamente esa función no existe en YouTube. Tendrán que hacerla los propietarios del material de forma ajena a YouTube.
Un Saludo.