Hola Miguel,
Como bien te acaban de comentar, puedes tener la monetización activada de forma selectiva en todos los canales que crees.
Da igual que estén bajo la misma cuenta o no.
Eso si, como ha mencionado "YouTube Siempre", las normas hay que respetarlas.
Aunque se trate de canales diferentes, las sanciones pueden repercutir en todos los canales o incluso a ti como persona, impidiendote acceder a YouTube o monetizar mas videos en el futuro.
Saludos a todos :)