Hola. A mi hace tiempo me sucedía lo mismo y lo pude resolver de esta manera: Descargue el programa windows live essentials, este programa contiene el windows live movie maker (no confundir con el windows movie maker, que viene por defecto en windows). El windows live movie maker te permite guardar tu película en varios formatos permitidos por youtube: WMV, MP4, Etc.
Ojalá esto te sirva.
Saludos.