Actualmente no hay opción para ocultar los vídeos recomendados.,Puedes seleccionar ''Toda la actividad'' en tu página de inicio para que sean menos visibles entre la actividad de tus suscripciones y amigos, pero no la puedes eliminar o desactivar.
En cuanto a la lista ''ver más tarde'', puedes eliminar los vídeos en ella cuando quieras, sólo debes acceder a ella, seleccionar los vídeos y hacer clic en eliminar
http://www.youtube.com/my_watch_later_list