Muy incómodo ciertamente. A YouTube le dio por organizarlas en orden de creación en lugar de orden alfabético, haciendo las cosas más complicadas para aquellos que tienen muchas listas. Esto fue hace varias semanas ya, y no hay señas de cambios al respecto aún :(
Sugeriría que mientras tanto, uses la función de búsqueda que trae el navegador (se suele activar presionando Ctrl + F). Puede ahorrarte algo de tiempo al buscar entre muchas listas, sólo debes escribir su nombre o parte de este para que el navegador la señale.