Hola
Cuando tu eliminas un video de una lista de reproducción desde un celular y te encuentras logeado con el mismo canal con que se subió el video, lo que estas haciendo en realidad es borrando el video de YouTube, NO de la lista de reproducción. Es una confusión que hay con los términos de la plataforma, a mi me ocurrió lo mismo hace 1 año, por error elimine un video desde el celular pensando que lo estaba sacando de la playlist.
Saludos.