Si el vídeo está siendo monetizado por el usuario que lo subió, este puede bloquear determinadas categorías de anuncios y anunciantes. Si tú subiste ese vídeo y lo estás monetizando o eres partner, entonces puedes acceder a la cuenta AdSense y bloquear los anuncios de ese anunciante, o categoría de anuncios.
Si tú subiste el vídeo, pero los anuncios no aparecen porque lo hayas monetizado, sino porque tiene contenidos de terceros identificados (una pista de audio por ejemplo), entonces es el dueño de los derechos de ese contenido es quien ha puesto los anuncios y en ese caso, no puedes controlarlos.
Si el vídeo no fue subido por ti, no hay ninguna forma de controlarlo. Recomiendo que trates de usar música (y demás contenidos) de la que tengas todos los derechos o las licencias necesarias, para evitar que un tercero ponga nuncios en el vídeo debido a que usas sus contenidos.