Cierto, pensaba que aparecian esas marcas tambien para este tipo de cosas, ya veo que no, pero he averiguado como hacerlo. Gracias Gari.
Ya se como hacer lo que quería, por si le sirve a alguien me lo explico a mi mismo por escrito. Vas a anotaciones dentro del Gestor de video, editar un video cualquiera. En la parte superior te aparece un mensaje en azul que te sugiere habilitar las anotaciones con enlaces externos, hacemos click en habilitar a la derecha y a mi se me ha quedado en una ventana en blanco, pero al refrescar un par de veces ya he salido al editor del video de nuevo.
Hecho esto en la misma ventana para poner anotaciones, ahora aparece una opcion de la nota debajo del texto, tipo de letra, tamaño etc, con un recuadro que pone enlace externo. Hacemos click y aparece para poner un link, que tipo de link es y en caso de que sea un video, pegamos el link de nuestro video y despues podemos poner el tiempo en el que queremos que salte.
Es cuestión de ver el aviso para habilitar este tipo de enlaces en las anotaciones.
