Puedes empezar por
http://www.google.com/videotargeting/aw/listMediaPlans para seleccionar el tipo de anuncio, la ubicación geográfica a la que estará dirigida la campaña y los canales o vídeos de partners en los que quieres que aparezca el anuncio, después lo exportas a AdWords y allá creas el anuncio y configurarás el presupuesto y todo lo demás.
Los vídeos con reparto de ingresos muestran dos anuncios en general, el banner que aparece dentro del reproductor y el cuadro que aparece al lado derecho, no se pueden añadir más anuncios. Quizá se puede cambiar el tipo de anuncio, pero no se pueden mostrar más de 2 como lo dije anteriormente.
Creo que puedes hacer que el anuncio de tu tienda sea del tipo ''Superposición integrada en vídeo'' que aparece dentro del reproductor del vídeo y que el otro anuncio siga apareciendo como normalmente lo hace en los vídeos de partners o viceversa (tu eres otro anunciante), no creo que haya problemas con los otros anuncios, estos deberían seguir apareciendo.
Sólo trato de ayudar, pero no soy un experto en AdWords realmente...