Los vídeos no se borran salvo que el propio dueño del canal lo haga o YouTube te cancele el canal. Es probable, por ejemplo, que hasta ahora ingresabas a tu canal con un nick (nombre ficticio) y por pedido de YouTube cambiaras a un nombre real, de ser así, se ha creado automáticamente otro canal con este nuevo nombre.
Los vídeo los sigues teniendo y los veras si ingresas con tu nombre anterior, solo que ahora tienes dos canales.
Saludos.