Hmm.. tal vez podrías intentar reducir el peso de ése vídeo. Antes de subir un vídeo yo suelo convertirlo a Avi (con codec DivX) y también bajarle la resolución (640x360, que es lo suficiente para que el vídeo ocupe todo el tamaño del reproductor de Youtube) con un conversor gratuito llamado "Format Factory", de ese modo un vídeo de por ejemplo 15 minutos me puede llegar a ocupar una media de 300 MB. Así lo podrás subir en menos tiempo y tal vez cueste menos procesarlo.
"en la primera ocasión, no me fije que el vídeo estaba girado entonces lo que intento es subirlo para que se muestre de la forma correcta."
Por si te interesa, el editor de vídeo que tiene Youtube permite girar vídeos.