Yo pienso que no deberían haber dos versiones, pero el Español no es el único idioma que tiene más de una versión en la interfaz de YouTube. También hay dos versiones de Inglés: una para Estados Unidos y otra para reino Unido... También hay dos en Portugués: una para Brasil y supongo que la otra para Portugal.
No hay grandes diferencias entre ellas, pero algunas secciones y elementos tienen distintos nombres en cada una, que generalmente significan lo mismo, solo que supongo que se usan términos más comunes para esas ubicaciones. Algunas veces me extraña como nombran algunas secciones, especialmente en la versión Latinoamérica.
En casi todas las páginas de YouTube si ves al final, en la parte de abajo, encontrarás una opción para seleccionar idioma, un menú desplegable que debería decir [Español▼].