Hola Cristian,
Si no he entendido mal, quieres que cuando cliques sobre un enlace de una pagina web desde Chrome, te aparezca la opción de elegir con que programa quieres abrirlo.
Hasta donde yo sé, esa opción no existe en Chrome.
No obstante, puedes enviar tu sugerencia directamente a Chrome:
Clica sobre el icono de menú de Chrome situado en el esquina superior derecha.
Selecciona Ayuda.
Selecciona Notificar un error.
Añade los detalles de tu solicitud.
El departamento de Chrome leerá tu feedback, por lo que cuantas más solicitudes de esta característica reciban, más probable será que actúen en consecuencia.
Si tienes más ideas no dudes en sugerirlas!