Pues sí, ahora que me fijo tus marcadores han desaparecido. Esos 3 que se ven en
Sincronización de Chrome están siempre ahí pues corresponden a las carpetas básicas que almacenan a todos los demás.
Desconozco el motivo por el que se han perdido, lo siento. ¿Qué hacen esas extensiones que tienes instaladas? Quizás alguna de ellas actúa sobre ellos y ha funcionado mal, pero bueno, en definitiva: ¡los perdiste!
Saludos.