Bueno primero tenes que exportar tus marcadres de IE. (asumo que usas ie8)
Abri IE, entra en Favoritos, desde las herramientas de Favoritos selecciona "Importar y Exportar".
Dentro de este menu, se te dan 3 opciones, selecciona "Exportar a un archivo", selecciona las cosas que quieras exportar (favoritos, cookies, fuentes), luego selecciona la o las carpetas que quieras y exportalas. Guarda este archivo en algun lugar accesible, como el Escritorio de Windows. Y listo, cerra IE.
Abri Google Chrome.
Entra en Herramientas\Administrador de Marcadores - (O bien apreta CTRL + MAYUS + B)
Una vez dentro de Administrador de Marcadores, selecciona Herramientas\Importar Marcadores y busca el archivo que habias exportado del IE y seleccionalo. Vas a ver que las cosas que habias seleccionado en la "exportacion" de IE, ahora te aparecen "importadas" en Chrome.
Te dejo mas datos en las referencias
