Hola JuanchiTri,
Eso que comentas creo que puede deberse a que los accesos directos pueden venir de otros perfiles de usuario de Windows, que de algún modo se han compartido a ese. Revisa eso y, si puedes, intenta eliminarlos desde un perfil con privilegios de administrador en tu sistema Windows.
De todas formas, voy a pasárselo a los expertos de Chrome, que seguramente tengan más idea que yo aquí, en Google+.
Un saludo.
