Hola
Leandro, entra en el Administrador de marcadores, selecciona la Barra de marcadores, selecciona el primer marcador, baja hasta el final de la lista y manteniendo pulsada la tecla Mayús selecciona el último. Con eso consigues seleccionarlos todos y supongo que pulsando Supr podrás borrarlos todos de golpe. No lo he probado porque no tengo ganas de perder los míos.
Cuéntanos si te funciona.