Hola, intentare ayudarte aunque ahora mismo no tengo un ordenador delante, no se si sera un error de sincronización con los servidores de Google, puedes comprobar en esta web si las contraseñas se están sincronizando bien.
También puedes (después de haberte echo una copia de seguridad de tus marcadores y comprobado que se han sincronizado tus contraseñas correctamente) cerrar sesión de tu cuenta en chrome y volver a iniciarla, para ver si esta vez sincronizan bien tus contraseñas.
Por favor dinos como te va para en caso de que no se arregle ir buscando otras soluciones, un saludo.