Hola a todos,
daniela68, este debate es antiguo y ahora hay novedades, como la posibilidad de administrar varios usuarios en Chrome, lo cual también facilita mucho la eliminación del perfil, que es donde se guardan los datos que quieres borrar.
Entonces la solución que buscas está en eliminar el usuario que hayas utilizado durante tu sesión, logrando con ello que se borre todo rastro de tus marcadores, contraseñas y demás configuración. Lo que tengas almacenado en la nube permanecerá intacto.
Para probarlo ve a Configuración > Personal y ahí verás el apartado Usuarios. Trastea con él hasta lograr lo que buscas y no dudes en volver por aquí para más aclaraciones.
Y de propina: si te creas un marcador con la dirección de ese apartado, chrome://settings/personal podrás llegar a él con sólo un clic.
Saludos.