Ok, no hay nada que configurar, explico:
Chrome hace muchas cosas automáticamente, y no da opción de configuración manual, porque si no sería un mundo interminable de ventanitas de configuración que no sólo serían muy poco interesantes, sino que además serían una fuente infinita de problemas para gente que toca lo que no debe :)
Chrome intenta determinar el ícono que corresponde a cada marcador, igual que las vistas miniaturas. Sabemos que esos íconos y esas vistas pueden cambiar de vez en cuando, por eso Chrome cada tanto, cuando se le ocurre, intenta actualizarlos.
Por motivos que no vienen al caso, puede pasar que la imagen no esté disponible en ese momento (normalmente, porque el sitio no respondió). Entonces Chrome lo reemplaza por imágenes genéricas. Entonces te puede pasar que se "pierdan" algunos iconitos o miniaturas.
A veces, Chrome se ve obligado a reparar tu perfil por algún daño, y como esas imágenes no son datos prioritarios, se suelen perder, hasta que se Chrome decida actualizarlas.