Hola Laura, es la primera vez que me encuentro con un caso así.
No tengo elementos para guiarte hacia la solución, sorry.
Google respalda todo por lo menos por triplicado. Si bien teóricamente siempre existe una mínima chance de que todos los respaldos fallen a la vez y se pierda la información, nunca me topé con un caso así.
Cuando Google tiene algún problema con tus datos, los recupera, pero pueden pasar 24 hs antes de volver a estar disponibles. Claramente no es tu caso, por eso me inclino a pensar que no se perdieron en los servidores, sino que los borraron en Chrome.
Una posibilidad hipotética es que alguna extensión maliciosa los haya borrado. En esta línea recomiendo revisar la lista de extensiones instaladas, en chrome://extensions