Hola:
Te confirmo que funciona cuando unes en el mismo archivo tu certificado de dominio y el certificado raíz que te envía Comodo.
Los uní con
cat dominio.crt gs_root.crt > bundle_domini.crt
y luego lo modifiqué en la variable ssl_certificate (de nginx que es el servidor que usas) para que usara el archivo nuevo.
Espero te funcione también. Me comentas.
Saludos!