Hola de nuevo,
Acabo de probarlo y me abre correctamente los PDF en Google Chrome:
¿Ocurre con todos? Tal vez se trate de algunos archivos dañados...
La opción que comentas en Internet Explorer, lo estás descargando y abriéndolo con un programa.
Si quieres, te mando un PDF que a mi no me da ningún problema para que lo podamos probar.