¡Hola Robero!
No se pueden desactivar pero sí puedes configurar que te pregunte dónde se guardarán, lo cual te da la opción de cancelarla en ese momento.
De cualquier modo antes de descargar un archivo que pueda ser potencialmente peligroso (como los que tienen extensiones .exe, .dll o .bat para Windows y .dmg para Mac) verás que Chrome te pregunta antes de descargarlo. Visita los siguientes enlaces para obtener más información.
Espero haberte ayudado, ya nos contarás.
Saludos.