Hola puedes mirar la ayuda en
http://www.google.com/support/chrome/bin/answer.py?hl=es&answer=95574.
Tienes la posibilidad de elegir en que carpeta guardar cada archivo que descargues.
Haz clic en el menú Herramientas .
Selecciona Opciones.
Haz clic en la pestaña Avanzadas.
Para cambiar la ubicación predeterminada de las descargas, haz clic en Examinar en la sección "Descargas" y selecciona dónde quieres que se guarden los archivos.
Si prefieres guardar cada archivo en una ubicación específica, selecciona la casilla de verificación "Pedir ubicación antes de la descarga".
Haz clic en Cerrar.