Hola, intentaré ayudarte. Lo primero es una pena que desinstales Chrome ¿por algo en concreto? Bueno, al tema, no te preocupes los marcadores no desaparecen. Eso sí, antes de desinstalar chrome sincronizalos por si tienes alguno nuevo.
Como tú bien dices te aparecen en la carpeta marcadores del móvil y si alguna vez vuelves a instalarlos ahi estarán.
Si te hace falta aclarar algo más, ya sabes aquí estamos. Un saludo