Hola Luis,
Te recomiendo restaurar la sincronización de la cuenta antes de volver a intentarlo.
Este error me paso una ves porque la sincronización no enviaba los datos a los servidores de google y al volver a sincronizarse volvia a descargar lo que ya no estaba .
Si después de esto no funciona puedes eliminar elos Bookmarks sincronizados desde aqui:
pero luego debes iniciar sesión en algún ordenador para volver a sincronizar lo que tengas en local, esto solo elimina los datos del servidor para volver a enviarlos.
Si quieres editar tus favoritos directamente en el servidor de google puedes hacerlo desde esta web:
Saludos
